漏洞无非这么几类，XSS、sql注入、命令执行、上传漏洞、本地包含、远程包含、权限绕过、信息泄露、cookie伪造、CSRF(跨站请求)等。这些漏洞不仅仅是针对PHP语言的，本文只是简单介绍PHP如何有效防止这些漏洞。
1.xss + sql注入(关于xss攻击详细介绍)
其中占大头的自然是XSS与SQL注入，对于框架类型或者有公共文件的，建议在公共文件中统一做一次XSS和SQL注入的过滤。用PHP写个过滤函数，可由如下所示：
$_REQUEST = filter_xss($_REQUEST);
$_GET = filter_xss($_GET);
$_POST = filter_xss($_POST);
$_COOKIE = filter_xss($_COOKIE);
$_POST = filter_sql($_POST);
$_GET = filter_sql($_GET);
$_COOKIE = filter_sql($_COOKIE);
$_REQUEST = filter_sql($_REQUEST);
最简单的filter_xss函数是htmlspecialchars()
最简单的filter_sql函数是mysql_real_escape_string()
当然，谁都知道这种过滤filter_sql(详细防止sql注入)只能过滤字符型和搜索型的注入，对于数字型是没有办法的，但也说明做了这层过滤后，只需在后面注意数字型的SQL语句就可以了，遇到了加intval过滤就可以了，这就变得容易多了。
2. 命令执行
对于命令执行，可以从关键字入手，总共可分为3类
(1) php代码执行 ：eval等
(2)shell命令执行：exec、passthru、system、shell_exec等
(3) 文件处理：fwrite、fopen、mkdir等
对于这几类需要注意其参数是否用户可控。
3.上传漏洞
对于上传漏洞，也是重点关注的地方，要仔细分析它的处理流程，针对上传的绕过方式是很多的，最保险的方式：在保存文件是采用文件名随机命名和后缀白名单方式。其次要注意的一点是上传文件的地方可能不止一处，不要有遗漏，可能会碰到这样的情况，突然在某个目录里面包含了一个第三方的编辑器在里面。
文件包含漏洞涉及的函数如include() 、include_once()、require()、require_once()、file_get_contents()等
最常见的还是出在下载文件功能函数，例如download.php?file=../../../etc/passwd 这种类型中。
4. 权限绕过
权限绕过可分为两类吧
(1)后台文件的未授权访问。后台的文件没有包含对session的验证，就容易出现这样的问题
(2)未作用户隔离，例如mail.php?id=23显示了你的信件，那么换个ID, mail.php?id=24就查看到了别人的信件，编写代码是方便，把信件都存在一个数据表里，id统一编号，前端展现时只需按id取出即可，但未作用户隔离，判定归属，容易造成越权访问。
这样的例子是很常见的，给某银行做评估是就经常发现这种漏洞。
5. 信息泄露
信息泄露算是比较低危的漏洞了，比如列目录这种就属于部署问题，而与代码审计无关了，而像暴路径、暴源码这种是需要防止的。曾经遇到这样的代码
表面上似乎没问题，可是当请求变为 xx.php?a[]=1时，即参数变为数组的时候，就会发生错误以致路径泄露，而用isset判断则不会，当然一个个防太麻烦，建议在配置文件中关闭错误提示，或者在公共文件中加入代码以关闭错误显示功能。